『보이지 않는 지능』은 현대의 복잡성 과학이 대자연에서 발견한 규칙들을 다중지성 혹은 집단지성이라는 측면에서 살펴보고, 그 규칙들을 활용하여 생활 속에서 빈번히 발생하는 복잡한 상황에서 최선의 의사결정을 만들어낼 수 있는 방법을 제시한다. 자연에서 다중지성이 발달하는 모습과 그 기본 규칙에서 무엇을 배울 수 있는지 다루고, 인간 사회에서 다중지성을 발달시켜 복잡한 문제를 푸는 방법을 살펴본다. 또한 복잡성의 함정에 빠졌을 때 최선의 의사결정을 내릴 수 있는 간단한 규칙을 알아본다.

PART 01 보이지 않는 지능, 다중지성
 동물의 세계에서 배우기 / 과학을 통한 상상 세계에서 배우기 / 컴퓨터의 가상 세계에서 배우기

PART 02 메뚜기와 벌은 어떻게 영리한 결정을 내릴까
 메뚜기가 무리를 짓는 이유 / 장애물을 피해가는 규칙 / 메뚜기에게 배우는 충돌 방지 전략 / 벌의 의사소통 방식 / 보이지 않는 리더

PART 03 개미는 어떻게 길을 찾을까

PART 04 군중의 힘
 군중 속 개인 / 군중의 자기조직화 / 충돌에서 벗어나기 / 피할 수 없는 충돌 / 요약

PART 05 개인보다 집단이 똑똑하다
 평균값 취하기 - 다수 오차의 원칙 / 다수 의견과 배심원 정리

PART 06 합의에 숨겨진 진실
 자연에서 배우는 정족수 사례 / 투표로 완벽한 선택을 할 수 있을까 / 집단사고 / 아마존닷컴과 다중지성

PART 07 대유행과 의사소통, 그리고 네트워크 과학
 네크워크란 무엇인가 / 6단계 분리이론 / 허브와 링크 / 퍼뜨리기 / 유행과 임계값 / 요약

PART 08 보다 나은 의사결정을 하려면
 전지(全知)한 인간은 없다 / 급박한 상황에서 의사결정 규칙

PART 09 상상력의 기본이 되는 규칙과 패턴
 상상력 / 벤포드의 법칙 / 램지의 정리 / 요약

PART 10 복잡한 문제를 해결하는 간단한 규칙