『과학 축복인가 재앙인가』에 실린 글들은 주로 지난 2년 동안 저자가 인터넷 과학신문 <사이언스 타임즈> 및 월간 『과학과 기술』에 연재했던 것들과 다양한 심포지엄 및 특별 기고를 통해서 발표했던 상념들을 정리한 것으로, 세계에 대한 인식 양식이자 진리로서의 과학의 본질, 그것의 문명사적 가치 및 과학 발전이 가져올 수 있는 다양한 위험성에 대한 저자의 성찰 등을 담고 있다.

프롤로그

제1부 과학적 세계관
1. 과학 교육이 중요한 이유
2. 과학적 진리와 종교적 진리
3. 과학적 지식의 윤리적 초석
4. 과학적 세계관과 전통적 세계관
5. 과학의 개념과 과학 교육의 이념
6. 자연의 탈마법화와 시적 재마법화

제2부 과학의 양면성 
1. 과학 기술과 인간
2. 지구의 운명과 과학
3. 과학 기술의 모순된 양면
4. 과학에 대한 우리의 모순된 태도
5. 기술은 예술이다
6. 과학과 예술의 만남

제3부 문명의 묵시록 
1. 생태계의 묵시록
2. 과학 기술 문명의 악몽
3. 과학의 발달과 생태학적 성찰
4. 환경 위기 극복과 인식의 혁명적 전환
5. 생태 위기와 아시아의 생태 문화

 에필로그