『시크릿 사이언스 시리즈』2권《구멍에서 발견한 과학》. 이 시리즈는 친숙하지만 그것에 관한 여러 물음에 쉽게 답하기 힘든 소재와 주제를 다루는 교양과학 시리즈다.

2권 《구멍에서 발견한 과학》에서는 몸에 난 구멍과 자연현상으로 인해 생긴 구멍 등어디에서나 존재하는 구멍과 그 안에 존재하는 과학적 원리에 대하여 설명한다. 건빵의 구멍이 두개인 이유, 달의 크레이터 구멍 등을 통해 과학이야기를 흥미롭게 풀어낸다.

1. 도대체 왜 뚫려 있는 거니?
건빵 - 꼭 두 개의 구멍이어야만 하는 특별한 사연
 방패연 - 왜 너만 구멍이 뚫려 있니?
칼 - 구멍 뚫린 부엌칼이 잘 팔리는 이유
 시루 - 떡시루 구멍과 콩나물시루 구멍은 정반대?
목탁과 소라 - 함께 울고 함께 진동하는 맑은 소리
 대포 - 엄청난 폭발력을 견디는 아주 작은 구멍
 저금통 - 돼지 꼬리 구멍의 정체
 화분 - 작은 구멍이 생명을 위협한다
 연탄구멍 - 아궁이에서 피어나는 연소의 과학
 가스레인지 - 파란불과 빨간불을 결정하는 불구멍
 토큰과 엽전 - 같은 구멍이지만 사연은 다르다
 목욕탕 의자 - 얕잡아 보면 큰 코 다친다
 삼각자 - 동그란 구멍을 좋아하게 된 비밀
 파리채 - 파리 잡는 확률을 높이는 몇 가지 방법
 양말 - 구멍 뚫린 양말의 구멍 뚫은 양말의 대결
 모기장 - 1센티미터에 18개의 줄
 단추 - 왜 남성복과 여성복이 위치가 다른 걸까?
도트프린터 - 영수증 가장자리의 구멍은 왜 뚫려 있을까?

2. 집안에 뚫려 있는 기발한 구멍들
 수도꼭지 - 수돗물은 왜 밑으로 내려올수록 가늘어질까?
굴뚝 - 집 안을 시원하게 해주는 냉방용 굴뚝
 샤워꼭지 - 화장실의 물리학
 환기구 - 우리 집 헬스매니저
 문틈 - 무조건 막아라! 바늘구멍이 황소바람이다!
하수구 - 수질오염이 시작되는 첫 관문
 아궁이 - 부뚜막엔 고양이가 아니라 고래가 산다
 벽난로 - 사골집 아궁이에서 서양식 거실 문화로 변신
 열쇠구멍 - 열쇠가 자물쇠를 여는 원리

3. 현대 문명 속 구멍들을 찾아라
 극장 - 세상 모든 극장에는 구멍이 뚫려 있다
 비행기 - 왜 비행기 창문에는 성에가 끼지 않는 걸까?
사진기 - 낙타를 바늘구멍으로 통과시키다
 맨홀 - 원형으로 표시된 도시의 경락
 터널 - 왜 네모난 터널은 없는 걸까?
정수기 - 깨끗한 물을 만들어내는 반투막
 컴퓨터 - 세계 최초의 컴퓨터, 에니악은 구멍에서 시작되었다
 자동차 - 휠로 훨훨 날아가는 열
 제올라이트 - 끓는 돌이 이렇게 요긴한 거야?
라이터 - 부싯돌과 가스 노즐이 불구멍에 불을 붙인다
 전화기 - 수화기 구멍 속 소리의 과학
 펀치 - 구멍 뚫는 기계 속엔 아르키메데스가 산다
 디스켓 - 추억 속으로 사라진 구멍

4. 오, 위대한 구멍이여! 신기한 과학이여!
주전자 뚜껑 - 사소하지만 위대한 구멍
 도넛 - 세상 모든 도넛은 왜 똑같은 링 모양일까?
피리 - 과학을 노래하는 아주 오래된 구멍
 설탕봉지 - 적도를 항해하는 선원의 위대한 발견
 막대사탕 - 참 조그만 구멍이 참 신통하기도 하지
 빨대 - 빨대 장난은 장난이 아니다
 옹기 - 싱싱하게 살아 숨 쉬는 자연 담은 그릇
 김칫독 - 구덩이에서 꺼낸 발효 과학
 바늘구멍 - 식인종의 창에서 유래한 재봉틀의 바늘구멍
 우표 - 사무자동화의 시초가 된 가장자리의 구멍들
 신발끈 구멍 - 나비매듭이 건강에 좋다
 체 - 구멍의 기본 역할에 가장 충실한 도구

5. 우리 몸의 구멍들, 이유가 있다니까!
똥구멍 - 괄약근의 맹활약
 콧구멍 - 코는 한 개인데, 콧구멍은 왜 두 개일까?
땀샘 - 늘어진 개 팔자는 절대 상팔자가 아니다
 눈 - 우리의 눈 속엔 자동카메라가 있다
 귀 - 작은 귓구멍 속 복잡한 소리의 세계
 입 - 여자가 남자보다 쓴맛에 민감하다?
충치 - 치아에 구멍을 뚫는 범인은 누구?
목구멍 - 음식물이 기도로 들어가지 않는 이유
 후두 - 왜 여자는 남자보다 변성기가 심하지 않을 걸까?
배꼽 - 탯줄의 신비를 간직하고 있는 막혀 있는 구멍
 모공 - 얼굴에만 2만 개가 넘는다
 자궁 - 아기주머니에서 일어나는 놀라운 일들
 골다공증 - 여자들이 골다공증에 더 잘 걸리는 이유
 오줌구멍 - 소변의 원료는 혈액
 임플란트 - 잇몸에 목숨이 달려 있는 곳
 펀도의 흠 - 입 냄새가 심하다면?

6. 자연의 세계보다 흥미로운 구멍의 세계
 블로홀 - 자연과 세월이 빚은 천연 분수대
 동굴 - 환상의 세계로 안내하는 비밀 구멍
 크레이터 - 누가 달을 곰보로 만들었을까?
돌담 - 구멍 숭숭 제주 돌담의 지혜
 현무암 - 벌레 먹은 돌
 운석구멍 - 소행성과 지구의 충돌
 블랙홀 - 어떤 벌이 블랙홀로 변하는 것일까?
화이트홀 - 물리법칙을 무시하는 특이점의 세계
 웜홀 - 시간여행의 열쇠
 오존구멍 - 범인을 찾아라
 점토 - 열과 물과 소리를 잡는 점토 구멍
 숯 - 오랜 지혜가 담긴 천혜의 나노물질
 산굼부리 - 지구의 역사를 간직하고 있는 산에 생긴 구멍

7. 구멍만큼 사연도 많은 생명체들
 조개 - 세상에서 가장 처절한 죽음의 구멍
 돌속살이조개 - 기구한 사연의 바다의 조각가를 아시나요?
유공충 - 과거의 기후를 밝히는 결정적 단서
 딱따구리 - 시속 2,000킬로미터의 속도로 구멍을 뚫다
 벌집구멍 - 최소한의 재료로 최대 공간을 활용하는 정육각형
 개미구멍 - 개미는 가장 실용적인 건축가
 카멜레온 - 돌돌 말아 감춰둔 설공
 연근 - 공기의 통로이자 저장고
 가공 - 육지 식물과 수생 식물의 결정적 차이