교양 한국과학사. 이 책은 2004년 카이스트에서 한국 과학사 수업에 참여했던 학생들과 함께 발굴해 낸 한국사의 중요한 과학 발명품들에 대한 내용을 소개하고 있다. 첨성대와 에밀레종, 고려청자, 자격루, 수원 화성 등 한국사에서 주요한 과학 발명품과 과학 100년의 발전에 관한 내용을 흥미롭고 이해하기 쉽게 설명하고 있다.

《우리 과학의 수수께끼》에서는 첨성대는 천문대인지, 에밀레종을 울게 한 건 무엇인지, 고려청자 비취색의 비밀과 수원화성에 관한 이야기 등 한국사에서 중요하고도 신비로운 7가지 과학 발명품에 대한 이야기에 대하여 서술하고 있다.

책을 펴내며

1장_첨성대는 천문대인가
'뒷방 마님'의 화려한 부활｜별을 보다 vs. 천체를 관측하다｜첨성대의 역할을 둘러싼 억측 혹은 진실｜
신라인은 왜 하늘을 관측했을까?｜흙 속에 강인함이 있다｜'세계 최고(最古)' 타이틀은 타당한가?｜
조선시대까지 천체관측의 발달사 ｜ 보론·사료로 읽는 첨성대 이야기

2장_무엇이 에밀레종을 울게 했나
 에밀레종 신화의 과학적 고찰｜신라 최대의 프로젝트｜공학과 예술의 한판 승부｜맥놀이의 어설픈 기계화를 경계하라 ｜복원은 과연 신의 영역인가?｜백만 불짜리 복원 프로젝트의 주인공｜보론·사료로 읽는 성덕대왕신종 이야기

3장_고려청자 비취색의 비밀
 세계가 인정한 예술의 최고봉｜흙, 불꽃, 유약의 3박자가 빚어낸 기적｜상감기법은 고려인의 전매특허?｜
도자기 문화의 르네상스｜대량생산과 소량생산의 차이점｜청자 인터뷰｜고려청자는 고려에만 있었다?｜
청백의 우열 논쟁｜고려청자는 재연이 가능할까?｜보론·사료로 읽는 고려청자 이야기

4장_자동시계 자격루의 모든 것
 반쪽짜리 자격루의 슬픈 운명｜자격루의 구조와 원리｜자격장치를 징과 북으로 나눈 까닭은?｜
자격루의 구조에 관한 의문점들｜다른 나라의 물시계와 다른 자격루만의 독창성｜세종이 자격루를 만든 이유는?
｜보론·사료로 읽는 자격루 이야기

5장_《동의보감》의 진실을 찾아서
 한 남자의 불행이 한국 의학계를 살리다｜《동의보감》이 만들어진 시대적 배경｜'요약 노트'라는 오해에 대한 변명｜
서양의 해부학적 관점으로 동양의학을 보는 오류｜《동의보감》에 바치는 외부의 평가｜
 《동의보감》은 그대로 적용해도 좋은가?｜허준의 다른 의학 관련 저작들｜보론·사료로 읽는 동의 이야기

6장_수원 화성은 정말로 난공불락의 요새일까
 가상 시나리오 '화성 침공'으로 알아보는 수원 화성의 구조｜견고하게, 더욱 견고하게｜
2년 8개월, 기적의 주인공들을 만나다｜수원 화성의 비밀상자 《화성성역의궤》｜거중기 사용의 진위 논란｜
보론·사료로 읽는 수원 화성 이야기

7장_김정호는 누구를 위해 지도를 만들었을까
 오차를 최소화한 컴퓨터급 정확성｜접개식을 선택한 놀라운 센스｜현대식 기호화의 구현｜
김정호의 3대 지지와 3대 지도｜백성이 아닌 고위층 전용 지도로｜대동여지도에 도움을 준 사람들｜
보론·사료로 읽는 대동여지도 이야기

8장_우리 과학 100년의 발전사
 개항기의 서양과학｜뼈아픈 절반의 성공｜식민시대의 과학기술 억압｜고학 대중화에 팔을 걷어붙인 발명학회｜
나비 박사 석주명과 식민지 과학｜해방 후 한국과학의 홀로서기｜우장춘과 씨 없는 수박의 진실｜
이휘소는 과연 한국의 핵무기 계발에 참여했을까｜보론·KAIST 정재승 교수에게 듣는 한국과학 100년의 쟁점