이 혜명경은 불가 및 선종의 대표적 경전인 능엄경과 화엄경 및 육조단경 가운데에서 진실한 구절들을 가려 뽑아 내단수련의 각 단계에 맞게 배열한 다음 각 구절들에 대하여 수련의 실제에 맞는 구체적이고 명백한 해설을 붙인 책이다.

특히 수련과정에서 겪는 감각 내지 경치와, 각 수련의 단계에 맞는 공부 요령을 친절하게 구체적으로 설명하였기 때문에 스승 없이 이 책만으로도 공부를 이룰 수 있도록 되어 있다. 또한 유·불·선이 결국 같은 정상을 향하여 같은 길을 오르고 있다는 점과 석가께서 당시에 가르친 본래 뜻이 바로 이것이라는 점을 밝힌다.

머리말
 지은이의『혜명경(慧命經』머리말

1. 새어나감이 다함 없는 그림[漏盡圖]
2. 여섯 때의 마디를 나타내는 그림[法輪六候圖]
3. 임맥과 독맥의 그림[任督二脈圖]
4. 진리의 태아 그림[道胎圖]
5. 진리의 태아가 나오는 그림[出胎圖]
6. 불가사의하게 몸을 나투는 그림[出定化神圖]
7. 벽을 마주보고 큰 머무름에 드는 그림[面壁圖]
8. 허공으로 돌아오는 그림[虛空粉碎圖]
9. 혜명에 관한 말씀들을 모아서 설명함[集說慧命經]
1) 진리[道]의 큰 줄거리
2) 참다운 스승
3) 관자재보살(觀自在菩薩)의 진리
4) 음양을 화합(和合)하고 신(神)을 응집하는 법
5) 터전을 닦음
6) 선천(先天)의 기(氣)의 발동
7) 기초를 굳게 쌓는 법
8) 진리의 씨앗의 산출
9) 진리의 씨앗을 조화롭게 합해 내는 법
10) 진리의 씨앗이 생겨나는 경치
11) 진리의 씨앗이 생겨 나오는 때
12) 생겨 나오는 진리의 씨앗을 거두어 잡음
13) 진리의 씨앗을 불리는 절차
14) 진리의 수레바퀴를 굴리는 법
15) 머리 감고 몸 씻는 법
16) 사리(舍利)를 이루는 방법
17) 사리를 캐는 법
18) 진리의 태아를 뱀
19) 진리의 태아를 기르는 법
20) 진리의 화신이 세상에 나옴
21) 진리의 화신을 젖 먹여 키우는 법
22) 벽을 마주하고 크게 머무르는 법
23) 허공으로 돌아오다
24) 영원한 진리
10. 바른 진리를 수련함을 바로잡아 논함[正道修煉直論]
11. 부처의 바른 진리 공부를 바로잡아 논함[正道工夫直論]
12. 흩어짐 없이 머물러 사유함[禪]과 움직임의 조짐[機]을 논함
13. 여러 가지를 섞어서 설명함[雜類說]
14. 의심을 풀어줌[決疑]

혜명경을 읽고 발문(跋文)을 붙임
 부 록
 옮긴이의 말
 혜명경의 원문